圖／經濟日報提供
勤業衆信會計師陳惠明表示，第31580號函破壞公平課稅，第一，造成分年課稅的稅負高於合起來課稅的稅負；第二侵蝕虧損年度投資收益的免稅效果。
陳惠明指出，所得稅法第39條維持了公平合理課稅的機制，也就是分年課稅和合起來課稅的稅負應該是一樣的，但第31580號函釋卻破壞了此一機制。
以三年爲例（按函釋見解），假設甲公司第一年營業淨利虧損100萬元，投資收益200萬元，因投資收益不課稅，因此沒有課稅所得額、應納稅額。惟按解釋令，課稅所得額雖爲虧損100萬元，抵減投資收益後，虧損扣除數爲零。
第二年營業淨利爲100萬元，投資收益200萬元，全年所得額300萬元，前一年沒有虧損扣除數，課稅所得額爲100萬元，應納稅額17萬元（稅率17%）。
第三年營業淨利300萬元，投資收益200萬元，前一年沒有虧損扣除數，全年課稅所得額300萬元，應納稅額51萬元。
如果三年一起計算，營業淨利300萬元，投資收益600萬元，全年所得額900萬元，課稅所得額300萬元，應納稅額51萬元。
三年分開計算，共計繳納68萬元稅額，大於三年一起計算的51萬元稅額。
其次，根據所得稅法第39條，第二年時，應可扣除前一年的虧損扣除數100萬元，因此，第二年的課稅所得額、應納稅額都是零。如此一來分三年計算和合起來計算的稅額都是51萬元。
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